SOOLin toiminnanjohtaja työskentelee OAJ:n opiskelijatoiminnan asiantuntijana, joka hoitaa SOOLin toiminnanjohtajalle kuuluvia tehtäviä sekä vastaa opiskelijatoiminnasta ja muista järjestöllisistä tehtävistä OAJ:n järjestöpalveluissa.
SOOLin toiminnanjohtajan tehtäviin kuuluu liiton päivittäisen operatiivisen toiminnan johtaminen, hallituksen toiminnan tukeminen, liiton työntekijöiden esihenkilönä toimiminen, liiton taloudenhoito, sidosryhmäyhteistyö sekä jäsenten ja jäsenyhdistysten neuvonta. Lisäksi sijaisuuden aikana toiminnanjohtajan vastuulla on SOOLin liittokokouksen ja koulutusten järjestelyt sekä SOOLin talvipäiväyhdistysten tukeminen.